Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms