Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan12Q8BKT6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan12Q8BKT6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms