Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms