Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms