Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Jmjd4Q8BFT6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Jmjd4Q8BFT6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Jmjd4Q8BFT6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Jmjd4Q8BFT6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Jmjd4Q8BFT6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Jmjd4Q8BFT6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms