Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp3Q7TST5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms