Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms