Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Scn4bQ7M729 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Scn4bQ7M729 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn4bQ7M729 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn4bQ7M729 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn4bQ7M729 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn4bQ7M729 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn4bQ7M729 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn4bQ7M729 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn4bQ7M729 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn4bQ7M729 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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