Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScocQ78YZ6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms