Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stambpl1Q76N33 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms