Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rph3alQ768S4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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