Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms