Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SpopQ6ZWS8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms