Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrm2bQ6PEE3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrm2bQ6PEE3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms