Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms