Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpsf6Q6NVF9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms