Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nop58Q6DFW4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms