Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6DFW0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6DFW0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6DFW0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6DFW0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6DFW0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6DFW0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6DFW0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6DFW0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6DFW0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6DFW0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms