Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmcc1Q69ZZ6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms