Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms