Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc8eQ66JT1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms