Protein–RNA interactions for Protein: Q63934

Pou4f2, POU domain, class 4, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f2Q63934 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f2Q63934 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f2Q63934 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms