Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms