Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms