Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms