Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms