Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msi1Q61474 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms