Protein–RNA interactions for Protein: Q61088

Fzd4, Frizzled-4, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd4Q61088 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fzd4Q61088 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fzd4Q61088 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fzd4Q61088 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fzd4Q61088 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fzd4Q61088 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fzd4Q61088 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fzd4Q61088 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fzd4Q61088 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fzd4Q61088 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fzd4Q61088 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms