Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JrkQ60976 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JrkQ60976 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms