Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms