Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms