Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms