Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3aQ60520 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms