Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myh1Q5SX40 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms