Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trdv4Q5R1A3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trdv4Q5R1A3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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