Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp36l3Q5ISE2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms