Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ecm2Q5FW85 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm2Q5FW85 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms