Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl5Q5DTT4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms