Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Snx33Q4VAA7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Snx33Q4VAA7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Snx33Q4VAA7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Snx33Q4VAA7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx33Q4VAA7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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