Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc27Q3V036 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms