Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm6Q3UZD5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms