Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms