Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms