Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlrc4Q3UP44 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms