Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrch2Q3UMG5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms