Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxosQ3UL53 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms