Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LchnQ3UHG7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms