Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms