Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam35aQ3UEN2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam35aQ3UEN2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms