Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Puf60Q3UEB3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms